Les équipes

Groupe C Combet

Notre groupe effectue des recherches sur les cancers induits par des agents pathogènes par des moyens de la bioinformatique. Nous sommes particulièrement intéressés par le carcinome hépatocellulaire induit par les virus de l'hépatite B et C (VHB and VHC).

Nos activités couvrent :
- le développement des bases de données intégrant les séquences, structures et fonctions des macromolécules biologiques
- l’intégration d’outils bioinformatiques pour l’analyse des séquences et structures de protéines à travers des serveurs Web
- l’analyse de données de séquençage haut-débit (NGS)
- la bioinformatique structurale des protéines
- la bioinformatique appliquée



Figure 1
: Vue composée (A) d’un ensemble de données de séquences de protéines d’HBVdb, (B) des résultats d’une requête d’euHCVdb, (C) d’un alignement multiple de séquences des protéines HBc du VHB calculé dans NPS@, et (D) un modèle moléculaire par homologie du domaine ribonucléase H (RNase H) de la polymérase du VHB.


Nos principales réalisations de bases de données et de serveurs sont :
- BCL2DB : database of BCL-2 family members and BH3-only proteins
- BYKdb : the Bacterial protein tYrosine Kinase database
- euHCVdb : the European hepatitis C virus database
- Geno3D : An automated protein modeling Web server
- HBVdb : a knowledge database for Hepatitis B Virus
- NPS@ : Network Protein Sequence Analysis

Notre liste de publications peut être consultée dans PubMed et Google Scholars.
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