Centre de Découverte et de Développement du Médicament – C3D

Mesures biochimiques et biophysiques à haut débit :
– Lecteurs de microplaques Spark, Infinite F500 et Infinite M200 Tecan pour les analyses par luminescence, absorbance et fluorescence,
– Lecteur Dianthus NanoTemper pour les analyses par TRIC et spectral shift.

Robotique :
– Robot EVO 150 Tecan couplé à un incubateur de C0₂ à 37°C automatisé Liconic,
– Distributeur de micro-volumes HP D300 Tecan.

Collections de molécules :
– Banque Prestwick de 1 200 composés approuvés par la FDA,
– Banques Chembridge et ChemXinfinity de 52 000 composés diversifiés,
– Banque ChemXinfinity de 13 000 composés et banque FrPPIChem de 10 344 composés inhibiteurs d’interactions – protéine-protéine,
– Banque Edelris de 1 200 composés contenant des structures dérivées de produits naturels,
– Banque MedChemExpress de 590 composés inhibiteurs de kinases approuvés ou en phase clinique.

Purification de protéines :
– Système Akta go Cytivia.

Culture cellulaire in vitro 2D et 3D :
– Pièce de culture entièrement équipée,
– Système HCS Opera PerkinElmer avec logiciel d’analyse Spotfire TIBCO,
– Panel de plus de 20 lignées de cellules cancéreuses couvrant un grand nombre de cancers : cancers liquides, sarcomes, mélanomes, neuroblastomes, cancers du poumon, du côlon, du pancréas, du sein, du foie, du rein, de la tête et du cou.

Pour soumettre un projet à C3D, vous pouvez envoyer un mail à Stéphane Giraud, directeur scientifique de la plateforme.

Vous serez contacté dans les 48h pour convenir d’une réunion visant à définir vos attentes et mettre en place un plan d’action répondant à vos objectifs. En fonction des besoins, la plateforme peut éditer un devis de prestation ou participer à l’écriture de demandes de financement.

Les projets collaboratifs d’envergure importante sont quant à eux évalués par le comité scientifique de la plateforme afin de valider leur adéquation avec les objectifs du Centre de recherche en cancérologie de Lyon (CRCL).

Inhibition d’une interaction protéique favorable à la survie des cellules cancéreuses

L’équipe dirigée par Toufic Renno au Centre de recherche en cancérologie de Lyon (CRCL) a démontré que MYD88, une protéine adaptatrice impliquée dans l’inflammation, intervient également dans la voie de signalisation oncogénique RAS. Elle interagit plus précisément avec la protéine ERK1/2, permettant la transformation cellulaire dépendante de RAS in vivo et le maintien de la survie des cellules cancéreuses humaines.

A partir de cette découverte, un programme d’identification et de développement d’inhibiteurs de l’interaction ERK/MYD88 a été démarré avec la plateforme C3D. Un criblage in vitro, basé sur l’interaction des deux protéines, a permis de valider plusieurs séries de composés chimiques d’intérêt. Le développement de l’une de ces séries a ensuite conduit à l’identification d’une molécule preuve de concept.

Les études menées ont montré que l’inhibition de l’interaction ERK/MYD88 provoque une mort cellulaire apoptotique immunogène in vitro et déclenche une réponse des cellules T anti-tumorales in vivo. Ces travaux ont également conduit à la création de la start-up TheraPPI Bioscience spécialisée dans le développement d’inhibiteurs d’interactions protéine-protéine.

Pour en savoir plus : Virard F. et al. (2024). Targeting ERK-MYD88 interaction leads to ERK dysregulation and immunogenic cancer cell death. Nature Communications, 15:7037.