Profilage transcriptomique du microenvironnement immunitaire de la tumeur
Que faisons-nous ?
En nous concentrant sur les paramètres immunitaires, notre groupe est spécialisé dans l’analyse des profils génomiques et transcriptomiques au sein du microenvironnement tumoral et dans leur intégration aux données cliniques. Grâce à notre collaboration avec la plateforme de bio-informatique de Gilles Thomas, nous accélérons les découvertes qui font progresser la médecine de précision.
Responsable scientifique
Christophe Caux est un spécialiste de l’onco-immunologie reconnu pour ses travaux pionniers sur les cellules dendritiques humaines (CD), les chimiokines et les récepteurs Toll-like, qui ont débouché sur des stratégies visant à manipuler les CD et à réactiver l’immunité antitumorale. Ses recherches visent également à identifier les mécanismes de surveillance immunitaire et d’échappement, ainsi qu’à développer des stratégies thérapeutiques pour les tumeurs solides. Au sein du LICL, C. Caux a étudié des cibles telles que l’ICOS, le CD39/CD73 et les virus oncolytiques en vue du développement de médicaments, et a assuré le suivi immunologique d’approches originales en immunothérapie.
Nombre de publications >190, H-index = 75, et citations totales >28000.
Contact: christophe.caux@lyon.unicancer.fr
Techniques
- Analyse multi-omique utilisant WES, bulk RNA-seq, scRNA-seq dans une perspective immunologique.
- Intégration du séquençage d’ARN unicellulaire (scRNA-seq) et de la transcriptomique spatiale pour générer des connaissances de pointe en immunologie.
- Modélisation de la survie (régression de Cox) reliant les caractéristiques transcriptomiques, génomiques, de transcriptomique spatiale et immunologiques aux résultats cliniques.
Membres
- Christophe Caux, PhD, HDR, DRCE INSERM
- Léo Laoubi, PhD , Chercheur, Coordinateur scientifique