Organigramme de la plateforme :
– Sylvie Lantuejoul, responsable scientifique
– Nicolas Gadot, responsable opérationnel
– Francesca Damiola, chef de projet technologie DSP Nanostring
– Julie Valantin, référente IHC-HIS
– Laura Francols, référente techniques histologiques et qualité
– Clémentine Le Nevé, référente IF multiplex et technique DSP
– Céline Altun, attachée de recherche clinique
Cette plateforme permet de réaliser 6 à 8 immunomarquages multiplexes fluorescents sur une seule coupe tissulaire FFPE (Formalin-Fixed Paraffin-Embedded), grâce à une immunohistochimie séquentielle permettant le dépôt de complexes tyramide-fluorochrome. Cette technologie nécessite la maitrise des techniques d’IHC conventionnelle mais permet de s’affranchir des problèmes de réactions croisées entre espèces. Le scanner Vectra Polaris permet l’acquisition des images sur 9 canaux de fluorescence. La quantification spectrale et l’analyse des marquages peuvent se faire avec les logiciels Inform ou Halo.
Il s’agit d’une technologie innovante qui permet sur une seule coupe tissulaire FFPE, une quantification spatiale jusqu’à 96 protéines ou jusqu’à 18000 ARNs dans des régions d’interêt préalablement identifiées et allant de quelques cellules à 600µm de diamètre. Elle combine plusieurs techniques : 1- une approche morphologique et immunohistochimique pour déterminer les régions d’interet, 2- une technologie de type IHC ou HIS pour l’hybridation des anticorps ou des sondes couplés à des tag oligonucléotidiques, 3- une étape de quantification de ces oligonucléotides pour obtenir une évaluation précise de l’abondance de chaque protéine ou ARN.
